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Título: Uma metodologia para seleção de parâmetros em modelos de classificação de proteínas.
Autoria: OLIVEIRA, S. R. de M.
YAMAGISHI, M. E. B.
BORRO, L. C.
FALCAO, P. R. K.
SANTOS, E. H. dos
VIEIRA, F. D.
MAZONI, I.
JARDINE, J. G.
NESHICH, G.
Afiliação: STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA
MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA
LUIZ CÉSAR BORRO
PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA
EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA
FABIO DANILO VIEIRA, CNPTIA
IVAN MAZONI, CNPTIA
JOSE GILBERTO JARDINE, CNPTIA
GORAN NESIC, CNPTIA.
Ano de publicação: 2006
Referência: Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2006.
Páginas: 18 p.
Conteúdo: Os principais desafios relacionados ao problema de classificação de enzimas em banco de dados de estruturas de proteínas são: 1) o ruído presente nos dados; 2) o grande número de variáveis; 3) o número não-balanceado de membros por classe. Para abordar esses desafios, apresenta-se uma metodologia para seleção de parâmetros, que combina recursos de matemática (ex: Transformada Discreta do Cosseno) e da estatística (ex:.g., correlação de variáveis e amostragem com reposição). A metodologia foi validada considerando-se os três principais métodos de classificação da literatura, a saber; árvore de decisão, classificação Bayesiana e redes neurais. Os experimentos demonstram que essa metodologia é simples, eficiente e alcança resultados semelhantes àqueles obtidos pelas principais técnicas para seleção de parâmetros na literatura.Termos para indexação classificação de enzimas,predição de função de proteínas, estruturas de proteínas, banco de dados de proteínas, seleção de parâmetros, métodos para classsificação de dados.
Palavras-chave: Bioinformática
Classificação de proteínas
Mineração de dados
Série: (Embrapa Informática Agropecuária. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 14).
ISSN: 1677-9266
Tipo do Material: Folhetos
Acesso: openAccess
Aparece nas coleções:Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (CNPTIA)

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