Please use this identifier to cite or link to this item: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/2836
Title: Uma metodologia para seleção de parâmetros em modelos de classificação de proteínas.
Authors: OLIVEIRA, S. R. de M.
YAMAGISHI, M. E. B.
BORRO, L. C.
FALCAO, P. R. K.
SANTOS, E. H. dos
VIEIRA, F. D.
MAZONI, I.
JARDINE, J. G.
NESHICH, G.
Affiliation: STANLEY ROBSON DE MEDEIROS OLIVEIRA, CNPTIA
MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA
LUIZ CÉSAR BORRO
PAULA REGINA KUSER FALCAO, CNPTIA
EDGARD HENRIQUE DOS SANTOS, CNPTIA
FABIO DANILO VIEIRA, CNPTIA
IVAN MAZONI, CNPTIA
JOSE GILBERTO JARDINE, CNPTIA
GORAN NESIC, CNPTIA.
Date Issued: 2006
Citation: Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2006.
Pages: 18 p.
Description: Os principais desafios relacionados ao problema de classificação de enzimas em banco de dados de estruturas de proteínas são: 1) o ruído presente nos dados; 2) o grande número de variáveis; 3) o número não-balanceado de membros por classe. Para abordar esses desafios, apresenta-se uma metodologia para seleção de parâmetros, que combina recursos de matemática (ex: Transformada Discreta do Cosseno) e da estatística (ex:.g., correlação de variáveis e amostragem com reposição). A metodologia foi validada considerando-se os três principais métodos de classificação da literatura, a saber; árvore de decisão, classificação Bayesiana e redes neurais. Os experimentos demonstram que essa metodologia é simples, eficiente e alcança resultados semelhantes àqueles obtidos pelas principais técnicas para seleção de parâmetros na literatura.Termos para indexação classificação de enzimas,predição de função de proteínas, estruturas de proteínas, banco de dados de proteínas, seleção de parâmetros, métodos para classsificação de dados.
Keywords: Bioinformática
Classificação de proteínas
Mineração de dados
Series/Report no.: (Embrapa Informática Agropecuária. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 14).
ISSN: 1677-9266
Type of Material: Folhetos
Access: openAccess
Appears in Collections:Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (CNPTIA)

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
bp14.pdf576,17 kBAdobe PDFThumbnail
View/Open

FacebookTwitterDeliciousLinkedInGoogle BookmarksMySpace