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Research center of Embrapa/Collection: Embrapa Informática Agropecuária - Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Date Issued: 2006
Type of Material: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Authors: OLIVEIRA, S. R. de M.
YAMAGISHI, M. E. B.
BORRO, L. C.
FALCÃO, P. R. K.
SANTOS, E. H. dos
VIEIRA, F. D.
MAZONI, I.
JARDINE, J. G.
NESHICH, G.
Additional Information: Embrapa Informática Agropecuária.
Title: Uma metodologia para seleção de parâmetros em modelos de classificação de proteínas.
Publisher: Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2006.
Pages: 18 p.
Series/Report no.: (Embrapa Informática Agropecuária. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 14).
Language: pt_BR
Notes: Acesso em: 28 maio 2008.
Keywords: Bioinformática
Classificação de proteínas
Mineração de dados
Description: Os principais desafios relacionados ao problema de classificação de enzimas em banco de dados de estruturas de proteínas são: 1) o ruído presente nos dados; 2) o grande número de variáveis; 3) o número não-balanceado de membros por classe. Para abordar esses desafios, apresenta-se uma metodologia para seleção de parâmetros, que combina recursos de matemática (ex: Transformada Discreta do Cosseno) e da estatística (ex:.g., correlação de variáveis e amostragem com reposição). A metodologia foi validada considerando-se os três principais métodos de classificação da literatura, a saber; árvore de decisão, classificação Bayesiana e redes neurais. Os experimentos demonstram que essa metodologia é simples, eficiente e alcança resultados semelhantes àqueles obtidos pelas principais técnicas para seleção de parâmetros na literatura.Termos para indexação classificação de enzimas,predição de função de proteínas, estruturas de proteínas, banco de dados de proteínas, seleção de parâmetros, métodos para classsificação de dados.
Data Documento: 2006-11-17
Appears in Collections:Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (CNPTIA)

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