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Title: Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.
Authors: HIGA, R. H.
GIACHETTO, P. F.
YAMAGISHI, M. E. B.
IBELLI, A. M. G.
REGITANO, L. C. de A.
CARDOSO, F. F.
Affiliation: ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ADRIANA MÉRCIA GUARATINI IBELLI, Bolsista Capes, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL.
Date Issued: 2010
Citation: Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010.
Pages: 11 p.
Description: O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
Thesagro: Análise Estatística.
NAL Thesaurus: Gene expression
Algorithms
Statistical analysis
Principal component analysis
Keywords: Agrupamento de dados
Expressão gênica
Rede Genômica Animal
Análise de componentes principais - PCA.
Series/Report no.: (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 101).
Language: pt_BR
Type of Material: Folhetos
Access: openAccess
Appears in Collections:Comunicado Técnico (CNPTIA)

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