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| Ano de publicação | Título | Autor(es) |
| 2002 | Análise do grau de conservação de resíduos em proteínas com estrutura 3D resolvida utilizando o SMS. | HIGA, R. H.  ; BAUDET, C.; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. |
| 2002 | Apresentação gráfica de parâmetros protéicos utilizando o Java Protein Dossier. | HIGA, R. H.; BAUDET, C.; FALCAO, P. R. K.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. |
| 2006 | Aspectos computacionais da análise da co-evolução de aminoácidos que pertencem a uma proteína qualquer. | NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINAGLIA, T.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. |
| 2007 | Cálculo analítico de parâmetros estruturais de proteínas usando a teoria Alpha Shapes. | BEZERRA, G. B. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos; NARCISO, M. G.; FALCAO, P. R. K. |
| 2002 | Cálculo de área acessível por solvente utilizando SURFV - definição de interface intramolecular pelo SMS. | HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. |
| 2002 | Criação de um núcleo para a pesquisa e descrição dos serviços oferecidos na área de Bioinformática estrutural. | FALCAO, P. R. K.; HIGA, R. H.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. |
| 2002 | Curvatura da superfície de proteínas no Java Protein Dossier. | FALCAO, P. R. K.; BAUDET, C.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. |
| 2002 | Experiência de utilização de XML no SMS. | HIGA, R. H.; BAUDET, C.; FREITAS, E. M. de; SANTOS, G. F. dos; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. |
| 2004 | Grau de conservação de aminoácidos de proteínas: comparação entre entropia relativa e pressão evolucionária. | HIGA, R. H.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; MOURA, M. F.; FILETO, R.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. |
| 2005 | Identificando Pockets na superfície protéica usando o Java Protein Dossier - JPD. | YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. |
| 2002 | Incorporação das propriedades rotâmeros e ocupância em métodos de análise estrutural de proteínas. | FALCAO, P. R. K.; BAUDET, C.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. |
| 2006 | Uma metodologia para seleção de parâmetros em modelos de classificação de proteínas. | OLIVEIRA, S. R. de M.; YAMAGISHI, M. E. B.; BORRO, L. C.; FALCAO, P. R. K.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. |
| 2004 | Modelagem molecular da proteína small heat shock de Xylella fastidiosa. | FALCAO, P. R. K.; TADA, S. F. de S.; SOUZA, A. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; FILETO, R.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. |
| 2022 | Planos de gestão de dados acionáveis por máquina alinhados aos princípios FAIR para o Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa. | SOUZA, M. I. F.; VISOLI, M. C.; TORRES, T. Z.; FALCAO, P. R. K.; NHANI JUNIOR, A.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, F. R. da; CINTRA, L. C.; OSAWA, C. C.; SILVA, A. R. da; BARBOSA, L. A. F. |
| 2002 | Primeiro curso STING Millennium Suite Chemogenomics: ferramentas para analisar estruturas macromoleculares e aplicações em chemogenomics. | FALCAO, P. R. K.; SIQUEIRA NETO, J. L. de; HERNANDEZ FERNANDEZ, J.; HIGA, R. H.; BAUDET, C.; NESHICH, G. |
| 2006 | Projeções de superfície 3D no plano para análise de interfaces proteicas através do Sting. | NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINAGLIA, T.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. |
| 2006 | Rotâmeros raros no Java Protein Dossier. | YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; MAZONI, I.; VIEIRA, F. D.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. |
| 2002 | SMSLib - biblioteca C++ do Sting Millennium Suite. | HIGA, R. H.; BAUDET, C.; MANCINI, A. L.; MATTIUZ, A. R.; FREITAS, E. M. de; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G. |
| 2021 | Termos de Biologia e áreas afins úteis na catalogação de datasets ômicos no Repositório de Dados de Pesquisa da Embrapa: uma compilação de definições. | SOUZA, M. I. F.; GIACHETTO, P. F.; OSAWA, C. C.; VISOLI, M. C.; FALCAO, P. R. K.; TORRES, T. Z.; SILVA, A. R. da |
| 2021 | Termos técnicos úteis na catalogação de datasets ômicos no Repositório de Dados de Pesquisa da Embrapa: uma compilação de definições. | SOUZA, M. I. F.; VISOLI, M. C.; OSAWA, C. C.; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; TORRES, T. Z.; SILVA, A. R. da |
