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http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/5069
Title: | Análise preliminar de um processo para identificação e alinhamento de seqüências homólogas para proteínas com estrutura resolvida. |
Authors: | HIGA, R. H.![]() ![]() KUSER, P. R. ![]() ![]() YAMAGISHI, M. E. B. ![]() ![]() MANCINI, A. L. ![]() ![]() NESHICH, G. ![]() ![]() |
Affiliation: | Embrapa Informática Agropecuária. |
Date Issued: | 2003 |
Citation: | Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2003. |
Pages: | 7 p. |
Description: | O objetivo deste trabalho é apresentar e fazer uma avaliação preliminar de um processo alternativo, denominado Sequences Homologue to the Query (Structure-having) Sequence-SH2Q, para elaboração de alinhamentos múltiplos semelhantes à aqueles relatados no HSSP. O processo aqui apresentado baseia-se em programas de domínio público para busca em bases de dados de sequências -Blast (Altschul et al., 1990, 1997) e para alinhamento múltiplo de sequências -ClustalW (Thompson et al., 1994) O critério para avaliação do mesmo é o grau de similaridade entre as medidas de Entropia Relativa, quando comparadas com os mesmos valores relatados pelo HSSP. |
Keywords: | Processo para construção de alinhamento múltiplo |
Series/Report no.: | (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 48). |
Type of Material: | Folhetos |
Access: | openAccess |
Appears in Collections: | Comunicado Técnico (CNPTIA)![]() ![]() |
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