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Unidade da Embrapa/Coleção:: Embrapa Informática Agropecuária - Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Data do documento: 2003
Tipo do Material: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Autoria: HIGA, R. H.
KUSER, P. R.
YAMAGISHI, M. E. B.
MANCINI, A. L.
NESHICH, G.
Informaçães Adicionais: Embrapa Informática Agropecuária.
Título: Análise preliminar de um processo para identificação e alinhamento de seqüências homólogas para proteínas com estrutura resolvida.
Fonte/Imprenta: Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2003.
Páginas: 7 p.
Série: (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 48).
Idioma: pt_BR
Notas: Acesso em: 30 maio 2008.
Palavras-chave: Processo para construção de alinhamento múltiplo
Conteúdo: O objetivo deste trabalho é apresentar e fazer uma avaliação preliminar de um processo alternativo, denominado Sequences Homologue to the Query (Structure-having) Sequence-SH2Q, para elaboração de alinhamentos múltiplos semelhantes à aqueles relatados no HSSP. O processo aqui apresentado baseia-se em programas de domínio público para busca em bases de dados de sequências -Blast (Altschul et al., 1990, 1997) e para alinhamento múltiplo de sequências -ClustalW (Thompson et al., 1994) O critério para avaliação do mesmo é o grau de similaridade entre as medidas de Entropia Relativa, quando comparadas com os mesmos valores relatados pelo HSSP.
Ano de Publicação: 2004-02-27
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