Título:	Combinação de abordagens de análises de novo e guiadas pelo genoma para explorar dados de RNA-Seq de sementes oleaginosas para anotação de vias de ácidos graxos.
Autoria:	LEMOS, V. N. S. TOGAWA, R. C. COSTA, M. M. do C. RECH FILHO, E. L. GRYNBERG, P.
Afiliação:	VINÍCIUS NATTAN SILVA LEMOS ROBERTO COITI TOGAWA, CENARGEN MARCOS MOTA DO CARMO COSTA, CENARGEN ELIBIO LEOPOLDO RECH FILHO, CENARGEN PRISCILA GRYNBERG, CENARGEN.
Ano de publicação:	2021
Referência:	Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2021.
Páginas:	33 p.
Conteúdo:	Elaeis guineensis (dendê), Jatropha curcas (pinhão-manso) e Ricinus communis (mamona) produzem ácidos graxos que podem ser utilizados como fonte renovável na matriz energética, apresentando um grande potencial biotecnológico para as indústrias da área. O objetivo deste trabalho foi identificar transcritos relacionados com a síntese de ácidos graxos e inferir a sua presença em vias metabólicas. Para isso, o RNA total de sementes destas três espécies foi extraído e sequenciado. Os transcritomas foram montados utilizando abordagens de novo e guiados pelo genoma e filtrados com o programa Evidential Gene para a obtenção de resultados robustos. Uma base de dados contendo 527 sequências de 170 códigos de enzimas únicos de 12 vias de metabolismo de ácidos graxos foi gerada. Um total de 152, 156 e 150 transcritos de E. guineensis, J. curcas e R. communis referentes às proteínas pertencentes à 12 vias de metabolismo de ácidos graxos foram encontradas respectivamente, sendo 135 em comum. Os resultados ainda sugerem que há proteínas com expressão tecido-específicos pois 23, 6 e 11 proteínas de interesse de E. guineensis, J. curcas e R. communis não foram encontradas nos transcritomas, respectivamente. A estratégia desenvolvida neste trabalho mostrou ser eficiente para a mineração de dados de interesse em dados de RNA-Seq com baixa cobertura pois o uso de diferentes programas de montagem potencializou a identificação das proteínas.
Thesagro:	Dendê Mamona Elaeis Guineensis Jatropha Curcas Ricinus Communis
Palavras-chave:	Pinhão-manso RNA-Seq Vias metabólicas
Série:	(Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletem de Pesquisa e Desenvolvimento, 369.)
Tipo do Material:	Folhetos
Acesso:	openAccess
Aparece nas coleções:	Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (CENARGEN)