| Issue Date | Title | Author(s) |
| 2006 | Aspectos computacionais da análise da co-evolução de aminoácidos que pertencem a uma proteína qualquer. | NARCISO, M. G.  ; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINAGLIA, T.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G. |
| 2007 | Cálculo analítico de parâmetros estruturais de proteínas usando a teoria Alpha Shapes. | BEZERRA, G. B. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos; NARCISO, M. G.; FALCÃO, P. R. K. |
| 2003 | Cálculo de possíveis contatos atômicos internos a uma proteína ou entre proteínas no software SMS. | MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G. |
| 2004 | Grau de conservação de aminoácidos de proteínas: comparação entre entropia relativa e pressão evolucionária. | HIGA, R. H.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; MOURA, M. F.; FILETO, R.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. |
| 2005 | Identificando Pockets na superfície protéica usando o Java Protein Dossier - JPD. | YAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P. R. K.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. |
| 2006 | Uma metodologia para seleção de parâmetros em modelos de classificação de proteínas. | OLIVEIRA, S. R. de M.; YAMAGISHI, M. E. B.; BORRO, L. C.; FALCÃO, P. R. K.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. |
| 2004 | Modelagem molecular da proteína small heat shock de Xylella fastidiosa. | FALCÃO, P. R. K.; TADA, S. F. de S.; SOUZA, A. P.; YAMAGHISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; FILETO, R.; HIGA, R. H.; NESHICH, G. |
| 2006 | Projeções de superfície 3D no plano para análise de interfaces proteicas através do Sting. | GONÇALVES, M; N.; YAMAGISHI, M. E. B.; QUINAGLIA, T.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G. |
| 2006 | Rotâmeros raros no Java Protein Dossier. | YAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P. R. K.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. H.; SANTOS, E. H. dos; MAZONI, I.; VIEIRA, F. D.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. |
| 2007 | VPRO - um identificador de padrões de seqüências. | SANTOS, E. H. dos; FALCÃO, P. R. K.; NESHICH, G. |
