Please use this identifier to cite or link to this item: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/5069
Research center of Embrapa/Collection: Embrapa Informática Agropecuária - Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Date Issued: 2003
Type of Material: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Authors: HIGA, R. H.
KUSER, P. R.
YAMAGISHI, M. E. B.
MANCINI, A. L.
NESHICH, G.
Additional Information: Embrapa Informática Agropecuária.
Title: Análise preliminar de um processo para identificação e alinhamento de seqüências homólogas para proteínas com estrutura resolvida.
Publisher: Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2003.
Pages: 7 p.
Series/Report no.: (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 48).
Language: pt_BR
Notes: Acesso em: 30 maio 2008.
Keywords: Processo para construção de alinhamento múltiplo
Description: O objetivo deste trabalho é apresentar e fazer uma avaliação preliminar de um processo alternativo, denominado Sequences Homologue to the Query (Structure-having) Sequence-SH2Q, para elaboração de alinhamentos múltiplos semelhantes à aqueles relatados no HSSP. O processo aqui apresentado baseia-se em programas de domínio público para busca em bases de dados de sequências -Blast (Altschul et al., 1990, 1997) e para alinhamento múltiplo de sequências -ClustalW (Thompson et al., 1994) O critério para avaliação do mesmo é o grau de similaridade entre as medidas de Entropia Relativa, quando comparadas com os mesmos valores relatados pelo HSSP.
Data Created: 2004-02-27
Appears in Collections:Comunicado Técnico (CNPTIA)

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
comtec48.pdf791,21 kBAdobe PDFThumbnail
View/Open

FacebookTwitterDeliciousLinkedInGoogle BookmarksMySpace