https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/item/447 Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (CENARGEN) Tue, 26 May 2026 18:34:28 GMT 2026-05-26T18:34:28Z https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1186989 Título: Análise e expressão diferencial de BbrizLOG em tecidos reprodutivos de plantas sexuais e apomíticas de Urochloa brizantha. Autoria: FERREIRA, L. G.; DUSI, D. M. de A.; GOMES, A. C. M. M.; RODRIGUES, J. C. M.; IRSIGLER, A. S. T.; CARNEIRO, V. T. de C. Conteúdo: Espécies do gênero Urochloa, conhecidas como braquiárias, reproduzem-se predominantemente de modo assexual por apomixia. U. brizantha (syn. Brachiaria brizantha), gramínea amplamente cultivada em pastagens no Brasil, apresenta tanto reprodução sexual quanto apomítica. A manipulação de genes relacionados à apomixia desperta grande interesse biotecnológico. No contexto da regulação hormonal, citocininas desempenham um papel fundamental no desenvolvimento do óvulo e na regulação da reprodução. Este estudo apresenta o padrão de expressão do gene BbrizLOG durante o desenvolvimento do óvulo em plantas sexuais e apomíticas de U. brizantha, buscando associações com seu modo reprodutivo. Foram analisadas a estrutura do gene e sua expressão em diferentes estádios do desenvolvimento reprodutivo. Os resultados são discutidos em relação às possíveis implicações para a determinação do modo de reprodução em U. brizantha. Thu, 01 Jan 2026 00:00:00 GMT https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1186989 2026-01-01T00:00:00Z https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1183074 Título: Estudo da diversidade genética dos equinos Baixadeiro e Lavradeiro por ferramentas genômicas para conservação. Autoria: INGLIS, K. V. V.; FARIA, D. A. de; RODRIGUES, C. S.; BRAGA, R. M.; LIMA, F. C.; PAIVA, S. R. Conteúdo: Esse estudo teve como objetivo avaliar por meio de ferramentas genômicas os equinos Baixadeiro e Lavradeiro, que são grupamentos genéticos ameaçados de extinção, para apoiar programas de conservação e manejo genético. Foram genotipados 171 animais e após o controle de qualidade restaram 81 Baixadeiros e 68 Lavradeiros. Os Baixadeiros foram genotipados com 1.498 SNPs do EMBRAPA multispecies 65K Illumina Infinium1 chip, restando 1.452 após filtragem. Para os Lavradeiros, 62.793 SNPs do Beadchip GGP Equine 70K foram analisados, resultando em 11.904 SNPs após filtragem de qualidade. Nos Baixadeiros, foram analisadas duas populações, de acordo com o local da coleta, a heterozigosidade observada das denominadas Pop. A e PoP. B foram em torno de 0,46 e o coeficiente de endogamia (FIS) positivo sugere uma leve endogamia nas duas populações (Pop. A: 0,008 e Pop. B: 0,001). O grupamento genético Lavradeiro apresentou heterozigozidade observada igual a 0,32, e valor negativo do FIS indica ausência de endogamia (-0,01). Uma análise de correlação entre todos os indivíduos de cada um dos grupamentos genéticos (matrizes de IBD) mostra que poucos indivíduos apresentam grande grau de parentesco entre si, o que torna possível manejo reprodutivo do rebanho e manutenção da variabilidade genética. Juntando os marcadores em comum dos dois chips, e outros grupamento genéticos brasileiros de equinos, a distância genética (FST) foi determinada assim como a estrutura populacional usando ADMIXTURE e análise dos componentes principais (PCA). A estrutura populacional entre os rebanhos de Baixadeiro é constante, ou seja, sem diferenciação genômica, o mesmo observado no rebanho Lavradeiro, onde apenas alguns animais apresentam composição genômica diferenciada, o que agora pode ser investigado pela morfologia dos mesmos. Os grupamentos genéticos e demais grupamentos brasileiros apresentam uma proximidade genômica equivalente a uma proximidade geográfica, porém, em geral, os Lavradeiros são geneticamente diferenciados, o que não é observado entre os Baixadeiros e os demais grupamentos genéticos do Norte brasileiro. Distâncias genética entre Baixadeiro e Puruca e Marajoara por vezes não permite a separação de três grupamentos. A análise de exclusão de paternidade encontrou 21 relações duos nos Baixadeiro e 2 trios completos, enquanto nos Lavradeiro, 10 duos e 4 trios, resultados a serem olhados com cautela pois se baseiam na provável data de nascimento dos animais. Os resultados fornecidos com base em dados genômicos fornecem uma base sólida para futuros cruzamentos e coleta de germoplasma, assegurando a conservação dos grupamentos genéticos e evitando a extinção dos mesmos. O estudo é crucial para desenvolver estratégias de manejo sustentável, promovendo a conservação do material genético para as próximas gerações. Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1183074 2025-01-01T00:00:00Z https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1182294 Título: Diversidade genética das raças ovinas brasileiras: SNPs associados à cor da pelagem. Autoria: FARIA, D. A. de; RODRIGUES, C. S.; SILVA, K. de M.; FACO, O.; MORAES, J. C. F.; SOUZA, C. J. H. de; CAETANO, A. R.; MCMANUS, C.; PAIVA, S. R. Conteúdo: O objetivo deste estudo foi avaliar um painel com 13 marcadores do tipo polimorfismo de nucleotídeo único (SNP), funcionais e não funcionais, em genes previamente associados à determinação da pelagem (ASIP, MC1R, TYRP1 e MITF), visando à caracterização da cor da pelagem em ovinos brasileiros. Em estudos de SNPs, marcadores não funcionais são aqueles sem efeito direto conhecido sobre proteína ou expressão gênica. Foram genotipadas 1.152 amostras de DNA de ovinos de 15 raças, incluindo animais conservados ex situ no Banco Brasileiro de Germoplasma Animal (BBGA), e estimadas as frequências alélicas por raça em cada gene/região, bem como as frequências haplotípicas dos SNPs nos genes MC1R e TYRP1. No gene ASIP, a variante da inserção de 5-pb (AGGAA) da indel g.100- 105del (D5) foi a mais frequente, assim como o alelo G do loco rs401457425 A>G. No gene MC1R, o alelo T (E+) predominou no p.M73K e o alelo G (E+) no p.D121N, ambos associados a pelagem branca. No gene MITF, o alelo T do rs414386339 C>T foi o mais frequente, enquanto o alelo G do loco rs429090866 A>G predominou. Foram identificados três haplótipos para o MC1R, sendo o Haplótipo 1, associado à cor branca, o mais frequente, presente em 14 raças. No TYRP1, foram identificados quatro haplótipos, com o Haplótipo 4 presente em todas as raças. Conforme os resultados observados, as amostras de germoplasma do BBGA retém parte da diversidade genética das populações conservadas in situ. Apesar de ajustes para sua otimização serem recomendados, o painel reduzido foi eficiente em genotipar as raças ovinas brasileiras. Tal ferramenta pode ser aplicada em estudos de conservação de recursos genéticos e melhoramento animal, impactando diretamente a cadeia produtiva de lã e pele, sobretudo em raças localmente adaptadas de grande importância econômica, como a Crioula. Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1182294 2025-01-01T00:00:00Z https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1179430 Título: Uso de ferramentas genômicas no manejo do Núcleo de Conservação Animal da Embrapa Pantanal. Autoria: GUAZZELI, L. de M.; ARAUJO, A. M. de; SANTOS, S. A.; JULIANO, R. S.; RODRIGUES, C. S.; FARIA, D. A. de; PAIVA, S. R. Conteúdo: A Embrapa Pantanal possui um núcleo de conservação, onde são mantidos in situ rebanhos de ovinos, equinos e bovinos Pantaneiros. Esse estudo teve como objetivo avaliar a diversidade genética dos rebanhos equino e ovino, e através de ferramentas genômicas, gerar resultados práticos que auxiliam o manejo genético. Após o controle de qualidade, foram analisadas 81 e 102 amostras de ovinos e equinos Pantaneiros, com 2.549 e 1.476 SNPs respectivamente. Foi avaliada a diversidade, estrutura genética do rebanho e testes de exclusão de paternidade foram performados. Em termos de diversidade genética, a heterozigosidade observada (Ho) do rebanho ovino é igual a 0,412 e do equino, 0,472, e ambos os rebanhos apresentaram o coeficiente de endogamia (FIS) negativo, indicando uma considerável taxa de variabilidade genética e baixa endogamia. A análise de estrutura populacional dos ovinos Pantaneiros mostra duas composições genéticas distintas no rebanho, (K=2), sendo que essa segunda identidade genômica foi identificada como proveniente do Santa Inês. Os equinos Pantaneiros (K=3) mostram-se com uma estruturação ainda mais complexa, presença de outra(s) raça(s) ou subpopulações, as quais ainda não foram identificadas. O teste de exclusão de paternidade no rebanho ovino identificou 3 duos, informações estas que não estavam presentes na plataforma Alelo Animal. Nos equinos, o resultado foi de 19 trios e 33 duos, enquanto sete trios e 14 duos estão de acordo com as informações de pedigree registradas na Plataforma. Esses resultados apresentam uma oportunidade de enriquecer estratégias de conservação, orientando a seleção criteriosa de progenitores em cruzamentos futuros. Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT https://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1179430 2025-01-01T00:00:00Z