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Unidade da Embrapa/Coleção: Embrapa Pecuária Sul - Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Identificador: 12097
Data de Envio: 12-Abr-2011
Tipo do Material: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
Autoria: HIGA, R. H.
GIACHETTO, P. F.
YAMAGISHI, M. E. B.
IBELLI, A. M. G.
REGITANO, L. C. de A.
CARDOSO, F. F.
Informações Adicionais: ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ADRIANA MÉRCIA GUARATINI IBELLI, Bolsista Capes, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL.
Título: Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.
Edição: 2010
Fonte/Imprenta: Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010.
Páginas: 11 p.
Série: (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 101).
Idioma: pt_BR
Palavras-chaves: Agrupamento de dados
Expressão gênica
Rede Genômica Animal
Análise estatística
Análise de componentes principais - PCA.
Conteúdo: O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
Ano de Publicação: 2010
URI: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/885652
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