Título:	Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.
Autoria:	HIGA, R. H. GIACHETTO, P. F. YAMAGISHI, M. E. B. IBELLI, A. M. G. REGITANO, L. C. de A. CARDOSO, F. F.
Afiliação:	ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ADRIANA MÉRCIA GUARATINI IBELLI, Bolsista Capes, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL.
Ano de publicação:	2010
Referência:	Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010.
Páginas:	11 p.
Conteúdo:	O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
Thesagro:	Análise Estatística
NAL Thesaurus:	Gene expression Algorithms Statistical analysis Principal component analysis
Palavras-chave:	Agrupamento de dados Expressão gênica Rede Genômica Animal Análise de componentes principais PCA
Série:	(Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 101).
Tipo do Material:	Folhetos
Acesso:	openAccess
Aparece nas coleções:	Comunicado Técnico (CNPTIA)